Mars'ta bir tankere yerleştirilen bio-kimyasal bombanın patlamasıyla 1 km ötekideki nüfusun çoğunlukta olduğu yerde 500'ün üstüne kişi ölmüştür. Zanlının başına konan ödül şimdiye kadar konulan en büyük ödüldür. 300 milyon woolong. Bu olayın haberi Bebop'a bomba gibi düşer ve paraya her zamankinden aç olan ekip bu ödülü almak için yarışa girerler.

Yıl 2131; gelecek kaçınılmaz bir şekilde gelmiş ve beraberinde de büyük bir savaşı getirerek Dünya’nın büyük kısmı harap bir hal almıştır. Bu harabeler arasında, eski bir asker olan Deunan Knute robotlara karşı bir savaş sürdürmektedir. Bir gurup robota saldırmayı plânlamış ve tuzak kurmuştur. Çatışma başladığında hemen hemen bütün ekibini kaybeder ve yakalanır. Tam her şeyin sonu geldi denirken ortaya çıkan ES.W.A.T yazılı özel yapım robotlar Deunan’ı kurtarır. Meydana gelen ufak çatışma sonucunda saldırgan robotlar yok edilir ve Deunan baygın olarak uçağa bindirilir. Kendine geldiğinde ise hiç bilmediği bir yerde ve Bioroid denilen insanlarla karşılaşmıştır. Ancak asıl önemlisi uzun zaman önce kaybettiği ortağı Brialeos ile karşılaşmıştır, gerçi bu karşılaşma Deunan için tam bir şok olmuştur. Şimdi ES.W.A.T için çalışması ve Olimpus’un geleceğini koruma altına alması teklif edilmiştir. Asıl gerçek ise çok daha yakında O’nu beklemektedir.

Genç kadın savaşçı Deunan ve tecrübeli cyborg-asker Briareos hem partner hem de sevgilidir. Olympus'a hizmet eden E.S.W.A.T'nin üyeleri olarak, her soruna onlar bakmaktadır. İki savaşçı, ortaklığını, Tereus adında deneysel Bioroid'in aralarına katılmasıyla tes eder.