Gizemli bir virüs, Japonya'nın her bölgesine yayılır.Virüse yakalanan insanlara ise ZQN adı verilir.ZQN'ler insanüstü bir güce sahiptirler ve yakaladıkları kurbanlarına da virüsü enjekte etmektedirler. Hideo Suzuki (Yo Oizumi), bir lise öğrencisi olan Hiromi Hayakari (Kasumi Arimura) ile tanışır.Şehirden ikisi birlikte kaçarlar fakat Hiromi çoktan bir bebek ZQN tarafından ısırılmıştır. Dişleri olmayan bir bebek tarafından bulaşan virüsle Hiromi, yarı ZQN bir insan olur.Sonrasında ise bir barınakta hemşire Yabu (Masami Nagasawa) ile karşılaşırlar.Yabu, Hiromi'yi kullanarak bir antivirüs yapmaya çalışır.

Yazın şehirdeki bir yetimhaneden Hokkaido’da deniz kenarındaki ıssız bir köye gönderilen Anna, günlerini bataklığın içinde geçirmeyi hayal eder. İnsanların çoğunu içine alan sihirli çemberin dışında olduğuna inandığından etrafındakilerle mümkün olduğu kadar az iletişim kurup “sıradan yüzü”nü gösterir. Anna, kendisini olduğu gibi kabul edecek biriyle karşılaşamayacağını düşünür ama bu köyde tanıştığı Marnie, onu haksız çıkartır. Kısa sürede kaynaşıp çok iyi arkadaş olurlar ancak Anna, arkadaşlığın sıcaklığını tattığı kadar yeni arkadaşının geçmişini de merak etmeye başlar…

Eskiden seks işçisi olan ve geçmişinden pişmanlık duymayan bir kadın, küçük bir sahil kasabasındaki bento lokantasında çalışmaya başlar ve yalnızlık çeken insanlara destek olur.

Tokyo Metropolitan Polis Departmanı Mishou (Tanımlanamayan) Suçlar adlı özel bir birim oluşturmuştur. Bu birimin görevi, kanıt, tanık vb. materyaller olmaksızın çözülmesi oldukça güç davalara bakmaktır. Takeru Sebumi (Ryo Kase) muhteşem bir kariyere sahip bir dedektiftir. Metropolitan Polis Departmanı'nın SIT (Özel Soruşturma Timi)ne seçilmiş ve 27 yaşında tim komutanı olmuştur. Astlarından Yusaku Shimura'ya olanlar yüzünden Tanımlanmayan Suçlar birimine gönderilir. Saya Toma (Erika Toda) 201 IQ'ya sahip genç bir kadın polistir. Fazlasıyla eksantrik karakteri nedeniyle Toma ve Sebumi anlaşmakta güçlük çekseler de, birlikte özel güçleri (SPEC) olan suçluların peşine düşmek zorunda kalırlar. ‘SPEC~Ten’ geçen yılın TBS dizisinde SPEC (özel güçler) sahibi insanlarla ilgili çeşitli davaları çözmüş olan Toma Saya (Toda Erika) ve Sebumi Takeru (Kase Ryo) adlı iki ana karakteri hayranlarına geri döndürüyor...

Rei Kiriyama (Ryunosuke Kamiki), 17 yaşında bir shogi (Japon satranç oyuncusu) oyuncusu. Ortaokuldayken profesyonel bir shogi oyuncusu olarak girdi. Ailesinin ve küçük kız kardeşinin küçükken trafik kazasında öldüğü için Tokyo'da kendi başına yaşıyor. Bir gün, Rei Kiriyama komşuları olan üç kız kardeşle tanışır. Üç kız kardeş Akari Kawamoto, Hinata Kawamoto ve Momo Kawamoto. Bu, yıllar geçtikçe, shogi dünyasının dışındaki biriyle yaptığı ilk görüşmesidir. Kawamoto ailesiyle birlikte yemek yemek, Rei Kiriyama'ya sıcak duygular getirir. Rei Kiriyama, mezuniyet kariyerine devam ederken, komşularıyla yaptığı etkileşimler ona bir shogi oyuncusu ve bir kişi olarak büyümesine izin verir.

Babasının izinden giden Luca, annesini hain Ladja'dan kurtarmaya çalışır. Bunun için tek umudu, Zenith kılıcını kullanabilen ilahi kahramanı bulmaktır.

Bir zamanlar Battosai adlı acımasız bir suikastçı olan Kenshin'in hayatı, Tomoe Yukishiro adlı nazik bir kadınla tanışmasının ardından oldukça farklı bir yönde gelişir.

Keizoku SPEC'ten tanıdığımız Toma ve Sebumi'nin geçmişine odaklanılan bu özel bölümde Ninomae'nin de Toma'ya kin beslemesinin altında yatan gerçeklere biraz daha ışık tutuluyor. Sebumi'nin SIT dönemi ve Toma'nın sol elini nasıl kaybettiği özel bölümün ana konusunu oluşturmakta.

Kenshin Himura; nam-ı diğer Battousai, efsanevi bir kılıç ustasıdır. Meiji Restorasyonu'ndan sonra kılıçla öldürmeyi bırakmıştır. Köyde, kılıç ustalığı okulu işleten Kaoru Kamiya ile huzurlu bir hayat yaşamaya çalışmaktadır. Bir gün ustamızın en sevdiği yemek mekanı olan Akabeko Restaurant yıkılır. Kenshin Himura orada "Junchu" yazılı bir not bulur. Son düşmanı intikam ateşiyle yanan tanıdık biridir.