Itsuki Minami, en yakın arkadaşları Kazuma Mikura ve Onigiri ile sokak kavgalarına karışmasıyla ünlü bir okul öğrencisidir. Ancak, bir çift Air Trecks keşfettiğinde, gökyüzüne hükmetme konusundaki gerçek arzusu yükselir.

Hikaru Shidou, Umi Ryuuzaki ve Fuu Hououji, Tokyo Kulesi'ne yaptıkları görünüşte normal bir okul gezisinde karşılaştıklarında kader tarafından bir araya getirilen yabancılardır. Büyük bir ışık parlaması eşliğinde, gizemli bir kadının "Cephiro"yu kurtarmak için yakarışını duyarlar ve ortaokul kadın kahramanları aniden dev bir uçan balık tarafından süpürülür. Daha sonra, Usta Büyücü Clef adında bir adamla karşılaştıkları bilinmeyen bir diyara varırlar. Clef, kızlara Prenses Emeraude tarafından Sihirli Şövalyeler olarak kaderlerini gerçekleştirmeleri ve Cephiro'da barışı ve dengeyi yeniden sağlamaları için çağrıldıklarını bildirir. Bir zamanlar canlı ve huzurlu olan topraklar, Baş Rahip Zagato'nun Cephiro'nun istikrar direği görevi gören prensesi hapse atmasından bu yana kargaşa içinde. Sihirli Şövalyeler, Clef'in sözlerini gönülsüzce gerçek olarak kabul eder ve Cephiro'yu kötülüğün pençelerinden kurtarmak için bir yolculuğa çıkar.

Japon hükümeti finansal bir krizin eşiğinden devletin fonları ile kurtulmuştur, fakat halk arasında işsizlik, suç, intihar, umutsuzluk yaygındır. Kimimaro, babasının kaybolması ve annesinin ölümünden sonra anneannesi tarafından büyütülmüştür, burslu bir öğrenci olan Kimimaro’nun tek hayali istikrarlı rahat bir hayat yaşamaktır. Bir gün, karşısına geri ödemeli büyük miktarda para veren bir adam ile tanışır, kendi kaderi üzerinde radikal bir değişikli yaparak kendisini “Finans Merkezi”nde bulur.

On iki yaşındaki Gon Freecss, bir gün kendisine her zaman söylendiği babasının hayatta olduğunu keşfeder. Babası Ging bir Avcıdır - toplumun elit kesiminin bir yere gitme veya neredeyse her şeyi yapma lisansına sahip bir üyesidir. Babasının izinden gitmeye kararlı olan Gon, Avcı Sınavına girmeye karar verir ve sonunda babasını kendi başına bir Avcı olarak kanıtlamak için bulur. Ancak yolda, bir Avcı olmanın önceden düşünüldüğünden daha fazlası olduğunu ve karşılaşması gereken zorlukların dünyanın en zoru olarak kabul edildiğini öğrenir.